home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Internet Info 1994 March / Internet Info CD-ROM (Walnut Creek) (March 1994).iso / inet / resource-guide / chapter.3 / section3-1.txt < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1992-11-03  |  6.5 KB  |  181 lines
  1.  
  2.  
  3.  
  4.  
  5.  
  6.  
  7.  
  8.                                     GENE-SERVER
  9.  
  10.  
  11.             _A_d_d_r_e_s_s:
  12.                Dr. Dan Davison
  13.                BCHS-5500
  14.                Dept. of Biochemical and Biophysical Sciences
  15.                University of Houston
  16.                4800 Calhoun, Houston, Tx, 77204-5500
  17.  
  18.             _E_m_a_i_l: davison@uh.edu (Internet), DAVISON@UHOU (Bitnet)
  19.  
  20.             _P_h_o_n_e: (713) 743-8366 (Dr. Davison)
  21.  
  22.  
  23.             _D_e_s_c_r_i_p_t_i_o_n
  24.  
  25.             The Gene-Server is a mail response facility that will return
  26.             a specific GenBank (tm) entry requested via e-mail.
  27.  
  28.             Other Services:
  29.  
  30.             The server  now  distributes  Protein  Information  Resource
  31.             (PIR, also known as NBRF) protein sequence database entries.
  32.             The  VMS  and  ASCII  versions  of  PIR  are  available  for
  33.             anonymous FTP as well as via Gopher.
  34.  
  35.             Molecular biology software for Apple  Macintosh,  DOS,  Unix
  36.             and VAX-VMS computers is also available from the server.
  37.  
  38.             A number of information files (the  R.  Roberts  Restriction
  39.             Enzyme  database; sequence analysis reference, and such) are
  40.             distributed.
  41.  
  42.             The Matrix of Biological Knowledge Archive-Server files  are
  43.             now available only from this address.
  44.  
  45.             _N_e_t_w_o_r_k _A_c_c_e_s_s
  46.  
  47.             The server can be accessed via e-mail on the Internet,  BIT-
  48.             NET, and UUCP networks.  The addresses to use are:
  49.  
  50.             _________________________
  51.             The information in this section is provided  in  accor-
  52.             dance  with the copyright notice appearing at the front
  53.             of this guide.
  54.  
  55.  
  56.  
  57.  
  58.             August 13, 1992             NNSC        Section 3.1,  Page 1
  59.  
  60.  
  61.  
  62.  
  63.  
  64.  
  65.  
  66.  
  67.                gene-server@bchs.uh.edu (Internet)
  68.                bchs.uh.edu!genbank-server (Usenet)
  69.                gene-server%bchs.uh.edu@CUNYVM (BITNET)
  70.  
  71.             Please be aware that a mail response program is not  "smart"
  72.             and  can only respond to a limited set of commands.  GenBank
  73.             entries are available by name and accession number only.
  74.  
  75.             Your request can consist of one of the following:
  76.  
  77.                HELP
  78.                SEND HELP
  79.                SEND GB-LOCUS genbanklocusname
  80.                SEND INDEX indexname
  81.                SEND ACCESSION accession_number
  82.                SEND ACCESSION accessionumber(s)
  83.                SEND KEYWORD genbankkeyword
  84.                SEND PIR-KEYWORD pirkeyword
  85.                SEND PIR-ACCESSION piraccessionnumber(s)
  86.  
  87.             There are many other parameters for specific subsets of  the
  88.             Gene-Server, please see the individual HELP files.
  89.  
  90.             "HELP" will result in a small help  file  being  sent  back;
  91.             everyone  should  request  the  help message.  The file will
  92.             contain up-to-date information  about  the  server,  access,
  93.             release  numbers,  and  policies.   The  help  message  also
  94.             includes all index names, so "SEND INDEX" no  longer  works.
  95.             "SEND  INDEX  index_name"  (where "index_name" is one of the
  96.             index files listed in the HELP message)  will  work.   "SEND
  97.             LOCUS   genbank_locus_name"   will  return  via  e-mail  the
  98.             requested locus if it exists, and an  error  message  if  it
  99.             does  not.   Use  the index file in the HELP message to find
  100.             the name of the entry, or use the accession number.
  101.  
  102.             Note that large GenBank entries (Lambda,  EBV,  tobacco  and
  103.             liverwort  chloroplasts)  may not make it through the thread
  104.             of mailers.  UUCP mailers, in particular, silently enforce a
  105.             limit  of  64,000 characters in a single mail message.  Note
  106.             also that Usenet mail is very unreliable;  you  should  con-
  107.             sult  the "pathalias" database to construct a mail path from
  108.             your machine to bchs.uh.edu.  A local Unix mail  wizard  may
  109.             be able to help.
  110.  
  111.             The Gene-Server itself silently  enforces  a  limit  of  one
  112.             megabyte on a reply. Please do not ask for a lot of software
  113.             or data in a single message.
  114.  
  115.  
  116.  
  117.  
  118.             August 13, 1992             NNSC        Section 3.1,  Page 2
  119.  
  120.  
  121.  
  122.  
  123.  
  124.  
  125.  
  126.  
  127.             IMPORTANT NOTE: "gene-server@bchs.uh.edu" is an  MX  record.
  128.             If  you  have problems reaching that address, ask your local
  129.             system mail expert how to  handle  addresses  that  are  "MX
  130.             records."  As a "very" last resort, send email to one of the
  131.             addresses given above.
  132.  
  133.             _W_h_o _C_a_n _U_s_e _t_h_e _G_e_n_e-_S_e_r_v_e_r
  134.  
  135.             Anyone can use the catalog.
  136.  
  137.             _M_i_s_c_e_l_l_a_n_e_o_u_s
  138.  
  139.             The current version of GenBank on the server is Release  64.
  140.             The  server  is  updated  as often as possible given funding
  141.             (none) and  disk  space  constraints.   The  server  may  be
  142.             updated daily in the future.
  143.  
  144.             Information and software is  exchanged  regularly  with  the
  145.             European  Molecular  Biology  Laboratory (EMBL) File Server,
  146.             and   the   molbio   ftp   sites,   "ftp.bchs.uh.edu"    and
  147.             "nic.funet.fi"; but the specific files, syntax, and informa-
  148.             tion vary between the four servers.
  149.  
  150.             The server contains a simple response to someone asking  for
  151.             too  many  loci  or  otherwise abusing the service: it stops
  152.             working for them.
  153.  
  154.             Questions  can  be  sent  to  davison@uh.edu  (Internet)  or
  155.             DAVISON@UHOU(BITNET).   Requests  to  talk to a human rather
  156.             than a mail response program  should  be  sent  to  archive-
  157.             management@bchs.uh.edu.    By   popular   demand,   archive-
  158.             managment@bchs.uh.edu also works.
  159.  
  160.             This service is provided  by  the  Institute  for  Molecular
  161.             Biology,  the Department of Biochemical and Biophysical Sci-
  162.             ences, and is funded by  the National Science Foundation.
  163.  
  164.             The server is not funded or related in any  with  the  DHHS,
  165.             PHS,  National  Institutes  of Health, or its contractors or
  166.             subcontractors on the GenBank contract.  GenBank is a trade-
  167.             mark  of  the US Department of Health and Human Services, US
  168.             Public Health Service.
  169.  
  170.  
  171.  
  172.  
  173.  
  174.  
  175.  
  176.  
  177.  
  178.             August 13, 1992             NNSC        Section 3.1,  Page 3
  179.  
  180.  
  181.